1、公司要清算结束，清算报告通过后，才能申请注销。而公司在民事诉讼未结案的，清算程序未结束，所以在结案前不能注销。
2、根据《中华人民共和国公司法》第一百八十四条的规定，清算组在清算期间行使下列职权：
(一)清理公司财产，分别编制资产负债表和财产清单;
(二)通知、公告债权人;
(三)处理与清算有关的公司未了结的业务;
(四)清缴所欠税款以及清算过程中产生的税款;
(五)清理债权、债务;
(六)处理公司清偿债务后的剩余财产;
(七)代表公司参与民事诉讼活动。
法律依据
《中华人民共和国公司法》第一百八十四条